但是誰都沒想到，原本已經霧散雲開的局勢，因為一個批文，轉瞬間又撲朔迷離起來。 因為華夏證券資金佔用的時間被拖的太久，因此，內部有人向上頭檢舉了邵淳。 邵淳被停職調查。 隨著邵淳的停職，遠在烏克蘭的瓦良格號又陷入了無人過問的狀態。直到邵淳接到了一個神秘的電話，歷史的車輪才重新滾動了起來。電話中的人告訴邵淳：「東方會中跟台灣借了2億美金，把瓦良格號抵押給了他們」。
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這又是一段歷史懸案。顯然當時台灣國安高層，也深知中共獲得航母後，對台海的威脅，而有了這一筆至今看來是一團迷霧的2億美金借款。是真？是假？至今也無從考證。但一接電話，了解問題是太嚴重的邵淳，打破官僚體制層層上報的關卡，直接找到有權拍板定案的中央高層。了解後，高層迅速批示：不惜一切代價把瓦良格號弄回來。既然已標到手了，政府無論如何要支持，協助完成任務，也不需要太遮遮掩掩了。
隨後政府正式接手瓦良格項目。這個由一群普通人接力創造的奇蹟，將由國家隊來畫上句號。華夏證券將與該項目相關的所有文件，全部上交國家。因邵淳為公不圖私保持一切完整的原始資料，不但使政府容易接手，也為爾後平反其指控，提供有利證據。官復原職。過程中邵淳個人是受盡煎熬、委屈、屈辱，但也因他的大公無私，才有瓦良格號回到中國成為遼寧號的新生。
此後，由中船重工集團，以澳門創立的名義，繼續推進該項目。瓦良格號的命運終於柳暗花明。一個尋常的夏日清晨，瓦良格號完成了最後的出海準備，在荷蘭拖船公司的牽引下，緩緩離開了他生活20多年的故鄉。看著逐漸消失在霧中的瓦良格號，廠長馬卡洛夫駐足良久，淚流滿面。
瓦良格回國的路上，有豺狼也有朋友。到達土耳其博斯普魯斯海峽前，土耳其政府，派遣多艘軍艦攔下拖船，下令瓦良格號返回黑海，不得通過。進退不得的瓦良格號，被迫開始了漫長的黑海漂泊。隨後幾個月裡，由澳門創立出面的交涉，全部石沉大海。不得已之下，中國政府正式出面，與土耳其政府展開外交談判。土耳其提出不能做到的放行條件是：瓦良格號要過去可以，要嘛把它一切為二，要嘛裝上動力系統。
儘管中國已經放下身段，許下各種許諾，土耳其依舊是一副，逮捕個蛤蟆，鑽出尿來的姿態，開出一拖拉庫的條件。吃飽喝足，土耳其答應放行，卻列出了20項放行的先決條款，其中包括10億美元的風險保證金。
行行行，只要讓我過你說啥就是啥。面對土耳其再三的無理要求，中國政府倍感無奈。好在希臘政府及時施以援手，提供了國家擔保，負責可能出現的賠償問題。這才免去了這筆天價的保證金。2001年11月，在11艘拖船和12艘救援消防船的前呼後擁下，瓦良格緩緩通過土耳其博斯普魯斯海峽。
在瓦良格號通過土耳其海峽的時候，土耳其政府派出了多艘軍艦，全程監視。在瓦良格號通過的時候，土耳其政府還封鎖了整個海峽，不允許任何船隻通過。
到了愛琴海附近水域，遭遇了前所未有的風暴。纜繩被刮斷，巨大的船體如一匹脫韁的野馬，在海上橫衝直撞。希臘派出救援船全力拯救，並派直升機接走了船上的7名中國船員。同時，希臘派遣船隻參與固定瓦良格。為此，一名希臘水手，在搶險過程中不幸罹難。
為了避免再意外，瓦良格號沒有選擇通過蘇伊士運河，而是經由直布羅陀海峽，多繞了大半個非洲大陸海岸線的路程。3個月後，命運多舛的瓦良格號抵達大連港，眾人懸著的心終於放了下來。我們可以想像，當時國際觀察家們驚惡嘴臉：「什麼？當初不是說好停在澳門的嗎？」鏽跡斑駁的瓦良格號航空母艦，形單影隻的停泊在大連港，一晃便是3年。在這三年間，瓦良格號彷彿無人問津也疏於管理，任何遊客都可以輕易接近它，並且合影留念。見此情景，之前那些心驚膽戰的國際觀察家們，就似乎略微鬆了一口氣。
然而，時間到了2005年4月26日的早晨，瓦連格在大批拖輪的護航下，被緩緩拖進了大連造船廠。整個過程約3小時，大連港航道全封鎖，大連造船廠也加強了保衛措施。至此，瓦良格號改頭換面，後變成了中國第一艘航空母艦——遼寧號。遼寧號是瓦良格號的新生，以遼寧號為基礎，經調整再造一條姊妹船，自此，瓦良格號不只有新生的遼寧號，更產出巒生的山東號。